一、组织形式不同
有限公司是独立的法人，具有企业法人资格，是由法定的股东组成，股东以其认缴的出资额为限对公司承担有限责任，公司以其全部资产对其债务负责的企业法人。
集团公司是一个企业联合体，以资本为主要联结纽带的母子公司为主体；以集团章程为共同行为规范的母公司、子公司、参股公司及其他成员企业或机构共同组成的具有一定规模的企业法人联合体。企业集团不具有企业法人资格。
二、特征不同
有限责任公司的特征：
1）有限责任公司的股东仅以其出资额为限对公司负责
2）人资两合性，有限责任公司的人合性，主要表现在公司股东之间，有点类似于合伙
3）封闭性既非公开性，在股东人数上，一般不超过50人
4）设立程序简单，一般来说，只要具备公司法具备的条件，即可申请开户
5）股东对公司活动存在积及参与
6）组织机构灵活，对于股东人数少，规模小的，可以设一名执行董事，不设董事会或设一至两名监事，不设监事会
集团公司的特征
1、集团公司的本质特征是：一种以母子公司关系为基础的垂直型组织体制。集团公司本身具有独立的法人资格，采取法人产权制度形式组成的有限公司或股份有限公司。集团公司是企业集团的核心企业，通常就是母公司，具有独立、有限的民事责任能力。
2、集团公司由一个母公司与若干个子公司组成。从法律上看，母公司即集团公司本身，它又包括若干子公司及关联企业。其中，子公司是指母公司掌握绝对控股地位一般持股50%以上的下属企业；关联企业则指母公司只拥有一般持股关系的参股企业，以及有各种固定性合作关系的企业。总之，母公司只能有一个，而子公司或关联企业可以有多个。
3、集团公司从内部组织关系来看，母公司以股权产权为纽带，垂直地向下控制其下属企业。包括：拥有全部产权关系的全资子公司母公司持有100%的股份，也称分公司；拥有一半股权以上的控股子公司母公司持有51-99%的股份；持有一定比例的参股关联企业持股25-50%称作质量参股子公司，持股低于25%称作任意参股子公司。这里它就不一定能称母公司了。通常子公司不能反过来向上持有母公司的股权。
4、集团公司在产权关系上比较清晰。集团公司一般是由原始发起公司经过不断发展扩张裂变而来的，对内通过投资设立分支企业，对外通过资本证券市场不断购并、控制其他竞争对手或相关企业，因而，母子公司之间血缘关系稳固、组合紧密。
