一、引起公司税务异常的原因：
1、没有按时进行记账和报税，公司没有实际经营不等于不需要进行记账和报税，一旦长时间没有记账报税税务信息就会出现异常，这样等到公司有实际经营的时候就不能开发票了；
2、长时间零申报，一般还没有经营，甚至在亏损期的企业，就会选择零申报；零申报其实是很常见的事情，但如果长时间零申报，就有可能被税务纳入“走逃户”，严重的还会被稽查。零申报连续6个月，税务部门可以吊销税务登记证，个别税务部门会按失效户处理；
3、经营地址异常，如果公司地址变更没有进行工商登记的，就会因为主管税务机关没有重新分配，从而影响报税，造成公司税务异常；
4、存在偷税漏税行为，偷税漏税行为是法律严禁的；一旦税务局发现公司存在偷税漏税行为，就会对公司进行处罚；在补缴税款之前，公司的税务信息就会显示异常。
二、企业出现税务问题的处理方法：
1、企业提供税务异常情况说明和解除税务非正常状态的正当理由；
2、若未清缴，可通过申报表作废功能作废原有申报，再进行重新申报；若已清缴纳，纳税人可通过申报错误更正功能进行更正。申报错误更正后，系统会自动根据前后申报信息判断应补退金额；
(1)应补退金额为正，系统会自动产生应补差额税款，纳税人在缴款期限内通过缴款功能补交税款即可，但如果超过缴款期限，则需要到大厅缴款；
(2)应补退金额为负，即出现多缴纳税款情况，则请纳税人到主管税务机关申请办理退税流程；
(3)应补退金额为零，则系统自动进行应征数据调整，纳税人不需补交税款或者办理退抵税流程。
3、办税服务厅接收申请材料，核对纳税人报送材料是否齐全、是否符合法定形式，符合的受理，不符合的驳回，并告知纳税人应补正资料或者补受理的原因（部分区域需要提供租赁合同、租赁凭证或者场地使用证明及近3个月的水电费单据）；
4、相关部门调查核实相关情况；
5、纳税人补充申报、补缴税款、滞纳金、罚款；
6、办税服务厅根据管理部门反馈情况，在纳税人补充申报、补缴税款、滞纳金、罚款后，解除纳税人非正常状态；
7、对已宣布其税务登记证件失效的纳税人收缴原税务登记证件，并重新发放税务登记证件。
